V souladu s Novelou zákona o vysokých školách přechází JAMU postupně ze stávajících studijních oborů na studijní programy se specializacemi. Po několik let tak budou souběžně studovat studenti ve studijních oborech, na které byli přijati a postupně budou přijímání studenti do již nově akreditovaných studijních programů a jejich specializací.
Obě fakulty, divadelní i hudební, uskutečňují tříleté bakalářské studijní programy a na ně navazující dvouleté magisterské studijní programy. Obě fakulty také nabízejí některé tzv. nenavazující magisterské studijní programy (čtyřleté nebo pětileté). Na obou fakultách lze pokračovat ve studiu ve čtyřletém doktorském studijním programu.
Programy a specializace podle nové akreditace
Divadelní produkce a jevištní technologie
Dramatická tvorba a média
Herectví
[CINHER]
[FYZDIV]
[MUZHER]
Divadelní produkce a jevištní technologie
Dramatická tvorba a média
Hra na varhany a duchovní hudba
Hra na dechové nástroje
[TUBA]
[TROMBON]
[LESROH]
[TRUBKA]
[FAGOT]
[KLARINE]
[HOBOJ]
[FLETNA]
Hra na strunné nástroje
[VIOLA]
[VIOLONC]
[KYTARA]
[HOUSLE]
[KONTRAB]
Hra na bicí nástroje a jazz
[JAZZKOM]
[JAZZINT]
[BICINAS]
Klavírní interpretace
[KLAINT]
[KLAPED]
[KLAKOM]
Dirigování, zpěv a operní režie
[DIRSBOR]
[ZPEV]
[OPREZIE]
[DIRORCH]
Hra na strunné nástroje
[VIOLA]
[VIOLONC]
[KYTARA]
[KONTRAB]
[HOUSLE]
Hra na bicí nástroje a jazz
[JAZZKOM]
[JAZZINT]
[BICINAS]
Historical performance (European Master of Early Music - EMEM)
Hra na dechové nástroje
[HOBOJ]
[KLARINE]
[LESROH]
[TROMBON]
[TRUBKA]
[TUBA]
[FLETNA]
[FAGOT]
Kompozice a teorie kompozice
Interpretace a teorie interpretace
Obory podle staré akreditace